Mutations rares répandues chez les personnes autistes (Spectrum News)

Article original : Rare mutations prevalent among autistic people

Traduction :

Selon une nouvelle étude, environ une personne autiste sur quatre porte des mutations génétiques rares dans des gènes fortement liés à l’autisme ou à d’autres troubles neurodéveloppementaux, bien plus que dans la population générale. Ces mutations se combinent avec des variantes génétiques courantes pour façonner les chances d’une personne d’être autiste, selon une étude connexe de la même équipe.

“Une grande partie des cas [d’autisme] ont une découverte génétique”, explique Joseph Buxbaum, professeur de psychiatrie à la Icahn School of Medicine du Mount Sinai à New York, qui a dirigé l’une des études.

L’année dernière, Buxbaum et ses collègues de l’Autism Sequencing Consortium ont identifié 102 gènes étroitement liés à l’autisme. Les personnes autistes présentant certaines variations d’une seule lettre dans les séquences d’ADN de ces gènes ont des quotients intellectuels plus faibles et des retards de marche plus importants, en moyenne, que les personnes autistes sans ces variations.

Ces mutations, qualifiées de variations d’un seul nucléotide “potentiellement dommageables”, sont individuellement rares – moins de 1 personne sur 10 000 dans la population générale les possède dans l’un de ces 102 gènes. L’équipe de Buxbaum voulait voir à quelle fréquence ces variations ou mutations tout aussi dommageables se produisent chez les personnes autistes.

Les chercheurs ont examiné la séquence ADN et les données chromosomiques de personnes autistes nées en Suède entre 1960 et 1996, participants à un projet en cours appelé Population-Based Autism Genetics and Environment Study (PAGES) qui a autorisé l’équipe à analyser leurs gènes.

Parmi les 808 participants pour lesquels les chercheurs disposaient de données de séquençage de l’ADN, 9 % présentaient des variantes d’un seul nucléotide potentiellement dommageables dans au moins l’un des 102 gènes. Parmi les 674 participants pour lesquels les chercheurs disposaient à la fois de données ADN et chromosomiques, 27 % présentaient des variantes ou des suppressions ou duplications d’un seul nucléotide potentiellement dommageables, appelées variantes du nombre de copies, dans au moins l’un des 102 gènes ou dans un plus grand ensemble de gènes connus. gènes liés au neurodéveloppement.

« Les personnes présentant des variantes dommageables de ces gènes ont souvent, mais pas toujours, une forme plus large de déficience intellectuelle. Ils souffrent également d’épilepsie plus souvent que la population générale et souffrent fréquemment d’autres troubles du développement plus rares », explique David Cutler, professeur agrégé de génétique humaine à l’Université Emory d’Atlanta, en Géorgie, qui n’a pas participé aux travaux mais a collaboré avec de nombreux chercheurs. les enquêteurs de l’étude précédemment.

Le dépistage des personnes autistes pour ces variantes potentiellement dommageables aiderait les médecins à prédire la probabilité de ces conditions, dit Cutler.

“De plus, si nous commencions à faire ces tests de manière routinière, nous identifierions probablement lequel des 102 gènes augmente le plus le risque de, disons, une déficience intellectuelle, et lesquels présentent un faible risque de déficience intellectuelle mais un risque substantiel d’épilepsie, etc. ” Le coutelier ajoute. De telles connaissances « pourraient être extrêmement utiles pour préparer les familles et formuler des régimes de traitement ».

L’évaluation des risques :

Dans une étude connexe, les scientifiques ont étudié dans quelle mesure les variantes génétiques communes et rares contribuent à l’autisme. Ils ont recherché les deux types de variantes dans les séquences d’ADN de 3 011 personnes autistes et 11 950 personnes non autistes, en tirant des données de PAGES, de la Simons Simplex Collection et du Electronic Medical Records and Genomics Network. (La collection Simons Simplex est financée par la Simons Foundation, l’organisation mère de Spectrum.)

Les chercheurs ont utilisé le nombre de variantes communes liées à l’autisme dans le génome de chaque participant pour calculer le « fardeau génétique » d’un individu.

Les personnes autistes portent un fardeau génétique plus important que les personnes non autistes, a découvert l’équipe. Et les personnes autistes qui portent des mutations rares ont un fardeau plus lourd que les personnes non autistes, mais un fardeau plus petit que les personnes autistes qui n’ont pas de telles mutations. Les deux études ont été publiées le 6 octobre dans Molecular Autism.

Les résultats soutiennent l’idée que des variantes rares et courantes agissent de manière additive pour influencer les chances d’une personne d’être autiste, selon les chercheurs.

“Plus le fardeau génétique est élevé, plus il est probable qu’il conduira à des manifestations cliniques”, déclare Christian Schaaf, directeur et président de l’Institut de génétique humaine de l’hôpital universitaire de Heidelberg, qui n’a pas participé à l’étude.

Cependant, les variantes rares ont généralement un impact plus important sur les traits de l’autisme que les variantes courantes, ou allèles. « Si vous avez des variantes à risque rares, vous aurez besoin de moins d’allèles à risque communs pour avoir un trouble du spectre autistique », explique Sagiv Shifman, professeur de génétique à l’Université hébraïque de Jérusalem en Israël, qui n’a pas participé à cette étude.

Les résultats suggèrent également que des mutations rares, dans de nombreux cas, ne sont ni nécessaires ni suffisantes pour provoquer l’autisme par elles-mêmes.

“Il faut encore les effets combinés de nombreux autres gènes, et probablement de certains facteurs environnementaux, pour pousser ces personnes au-delà du seuil de l’autisme”, explique Cutler. “J’espère que ces résultats seront utilisés pour mieux comprendre la suite de symptômes et de maladies associés observés à une fréquence plus élevée chez ces patients atteints de troubles du spectre autistique.”